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最新Anal. Chem.:新型三维分级多孔碳探针检测N-甘氨酸生物标志物和早期肝癌

7/1/2023 9:10:00 AM

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研究内容

由于肝细胞癌(HCC)的高度异质性,在发展的早期准确诊断HCC仍然是一项具有挑战性的任务。因此,需要通过发现新的生物标志物来进一步开发新的诊断方法,以提高HCC早期诊断率。

复旦大学张祥民、黄立豪、Hongbin Zhang和同济大学Qiuhong Man设计并制造了一种氧修饰的三维互连多孔碳探针,分析健康对照组(H)和肝功能障碍(HD)和HCC患者血清中N-聚糖的差异,从而发现HCC发展的新生物标志物。结果显示,12种血清N-聚糖的表达水平从H逐渐增加到HD患者,并最终增加到HCC患者。此外,基于这12种血清N-聚糖建立的两个机器学习模型在预测HCC发展方面达到了令人满意的准确性,其中受试者工作特征曲线达到0.95以上,用于区分健康对照组和肝病患者(HD或HCC),ROC曲线达到0.85,用于区分HD和HCC。相关工作以“Novel Three-Dimensional Hierarchical Porous Carbon Probe for the Discovery of N-Glycan Biomarkers and Early Hepatocellular Carcinoma Detection”为题发表在国际著名期刊Analytical Chemistry上。

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研究要点

要点1.作者使用有序的自组装聚(苯并恶嗪核心溶胶)聚合物作为碳前驱体,通过简单的热退火和后氧化工艺,设计并制造了一种具有分级孔的氧改性3D互连多孔碳(IPC-O)探针,用于富集N-聚糖。通过热退火制备的IPC不仅继承了聚(苯并恶嗪共聚甲阶)聚合物前体的无裂纹单体形态和塑性形状的特征,而且形成了三维互连的分级孔隙和优异的机械强度。在后氧化过程中引入丰富的含氧官能团的同时,多孔碳的原始单片形状、3D互连的分级孔和优异的机械强度也可以得到很好的保留。

要点2.得益于优异的塑性和机械强度,IPC-O探针可以通过使用特定的容器或后处理,在不添加任何粘合剂的情况下轻松地定制成各种形状,这将很好地满足实际应用的各种需求。IPC-O探针的3D互连的独特分级孔为聚糖快速流动提供了足够的通道,同时提高了底物-聚糖接触频率和丰富的含氧官能团,这些官能团改善了极性相互作用,从而提高了N-聚糖的捕获性能。

要点3.所制备的IPC-O探针显示出从人类血清中捕获N-聚糖的显著性能,并成功地在5 μL人类血清中鉴定了49个N-连接聚糖。IPC-O探针成功应用于分析健康对照组(H)和肝功能障碍(HD)和肝细胞癌(HCC)患者血清中N-聚糖的差异,发现在HCC进展过程中,12种N-聚糖的表达水平呈逐渐增加的趋势。结果表明,合成探针和基于这12个N-聚糖的机器学习模型不仅可以用于区分H与肝脏疾病,还可以特别区分HD与HCC,这使得该方法在以无创方式预测早期癌症发展方面具有潜在的价值。

该工作不仅为血清多聚糖的大规模表征开发了一种新的方法,而且为以无创方式准确、高灵敏度地诊断早期癌症的发展提供了有价值的指导。

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研究图文

图1.(a)IPC-O探针的合成程序。(b)复杂样品中N-甘氨酸富集程序的说明。

图2.(a)容器(a1)、前驱体(a2)、IPC(a3)和各种形状的IPC(a4)的光学图像;(b)IPC和IPC-O的机械强度试验;(c)IPC的SEM、(d)HR-SEM和(e)TEM(插图:SAED)。

图3.(a)N2吸附等温线;(b)IPC和IPC-O的相应孔径分布;(c)IPC和IPC-O的拉曼光谱;IPC和IPC-O的(d)XPS和(e)高分辨率C 1s光谱以及(f)IPC和IPC-O的水接触角测量。

图4.(a)使用机器学习策略推断糖尿病进展中特定改变的生物分子组合。(b)健康对照组(H)、肝功能不全组(HD)和肝细胞癌组(HCC)中N-聚糖的偏最小二乘判别分析(PLS-DA)评分图概述。(c)基于12种血清N聚糖的热图分析。(d)健康对照组(H)、肝功能障碍组(HD)和肝细胞癌组(HCC)中12个突出的N-聚糖的散点图。

图5. 稀疏学习的受试者操作特征(ROC)曲线,以区分健康对照组和提供诊断性能的肝病患者(a,b)。稀疏学习的受试者操作特征(ROC)曲线,用于区分HD患者和HCC患者,提供诊断性能(c,d)。

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文献详情

Novel Three-Dimensional Hierarchical Porous Carbon Probe for the Discovery of N - Glycan Biomarkers and Early Hepatocellular Carcinoma Detection

Jiaxi Wang, Jia Liu, Mengran Li, Yang Wang, Qiuhong Man,* Hongbin Zhang,* Li-Hao Huang,* Xiangmin Zhang*

Anal. Chem.

DOI: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c00533

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